Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLGNO14967 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms