Protein–RNA interactions for Protein: O00585

CCL21, C-C motif chemokine 21, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL21O00585 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL21O00585 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL21O00585 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL21O00585 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL21O00585 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL21O00585 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCL21O00585 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CCL21O00585 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CCL21O00585 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CCL21O00585 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CCL21O00585 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL21O00585 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CCL21O00585 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CCL21O00585 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CCL21O00585 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CCL21O00585 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CCL21O00585 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CCL21O00585 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL21O00585 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL21O00585 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL21O00585 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL21O00585 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL21O00585 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL21O00585 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL21O00585 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL21O00585 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL21O00585 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL21O00585 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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