Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms