Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms