Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VWA8A3KMH1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms