Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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ARL2-SNX15V9GYD0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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ARL2-SNX15V9GYD0 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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ARL2-SNX15V9GYD0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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ARL2-SNX15V9GYD0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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ARL2-SNX15V9GYD0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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ARL2-SNX15V9GYD0 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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ARL2-SNX15V9GYD0 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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ARL2-SNX15V9GYD0 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ARL2-SNX15V9GYD0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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