Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SH3BP1Q9Y3L3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SH3BP1Q9Y3L3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SH3BP1Q9Y3L3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SH3BP1Q9Y3L3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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