Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
UBE2J1Q9Y385 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms