Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
L1RE1Q9UN81 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms