Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2IRD1Q9UHL9 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms