Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTRF1LQ9UGC7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms