Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFD9

RIMBP3, RIMS-binding protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3Q9UFD9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 AC010894.2-201ENST00000444196 561 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMBP3Q9UFD9 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMBP3Q9UFD9 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms