Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms