Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms