Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.05■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UTP6Q9NYH9 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UTP6Q9NYH9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP6Q9NYH9 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms