Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TIMMDC1Q9NPL8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms