Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms