Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP2-4Q9BYR9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CNN2P1-201ENST00000453616 918 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms