Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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