Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP8Q99708 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP8Q99708 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP8Q99708 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP8Q99708 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP8Q99708 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RBBP8Q99708 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP8Q99708 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP8Q99708 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP8Q99708 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP8Q99708 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms