Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX27Q96L92 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms