Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SPTSSAQ969W0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SPTSSAQ969W0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SPTSSAQ969W0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SPTSSAQ969W0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SPTSSAQ969W0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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