Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 FREM3-201ENST00000329798 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SCN5A-209ENST00000451551 8343 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ACACB-201ENST00000338432 9360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 NEPRO-201ENST00000314400 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GRM4-202ENST00000374181 7275 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 NRP1-201ENST00000265371 5882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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