Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms