Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ATG16L1Q676U5 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ATG16L1Q676U5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ATG16L1Q676U5 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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ATG16L1Q676U5 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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ATG16L1Q676U5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG16L1Q676U5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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