Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q499Y3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q499Y3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q499Y3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms