Protein–RNA interactions for Protein: Q3YEC7

RABL6, Rab-like protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABL6Q3YEC7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABL6Q3YEC7 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms