Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 APLF-201ENST00000303795 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms