Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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