Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC96Q2M329 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms