Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KNOP1Q1ED39 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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