Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATP6V1FQ16864 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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