Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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