Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF239Q16600 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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