Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms