Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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ZNHIT3Q15649 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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ZNHIT3Q15649 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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ZNHIT3Q15649 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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ZNHIT3Q15649 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ZNHIT3Q15649 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ZNHIT3Q15649 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms