Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PDCD1Q15116 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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