Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARHGEF6Q15052 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARHGEF6Q15052 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms