Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SPIDRQ14159 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIDRQ14159 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
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SPIDRQ14159 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
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SPIDRQ14159 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPIDRQ14159 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPIDRQ14159 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SPIDRQ14159 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SPIDRQ14159 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIDRQ14159 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPIDRQ14159 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPIDRQ14159 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPIDRQ14159 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPIDRQ14159 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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