Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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