Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDAC1Q13547 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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