Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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