Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LSAMPQ13449 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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