Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DUSP4Q13115 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP4Q13115 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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