Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
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