Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXO1Q12778 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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