Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP27A1Q02318 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP27A1Q02318 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms