Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms