Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP5P82980 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP5P82980 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP5P82980 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP5P82980 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP5P82980 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RBP5P82980 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBP5P82980 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBP5P82980 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBP5P82980 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms