Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SH3BP2P78314 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SH3BP2P78314 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SH3BP2P78314 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SH3BP2P78314 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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SH3BP2P78314 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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